本部頃獲陸委會轉知國立臺灣大學及世新大學被列為海峽論壇之分支論壇主辦單位，本部將洽詢學校釐清是否有上揭情事。
陸委會已於5月30日發布新聞，針對「因應中共利用『海峽論壇』加大對臺統戰分化」表達政府立場：政府提醒民眾勿輕易參加「海峽論壇」相關活動以避免觸法，並提醒不得違法逕與中共簽署協議、備忘錄等文書。未經主管機關許可，也不得進行違法的合作行為或締結聯盟。據此，本部將提醒相關大學校院遵守政府政策立場及相關法令。
本部將持續提醒學校確實遵守兩岸條例等相關法規，如確有違反兩岸條例等相關規定，本部亦將依法裁處。