「2016臺日大學校長論壇」於105年5月12日在國立成功大學盛大舉行，本次論壇是臺日雙方首度以全國公私立大學校長、副校長為主要對象辦理之大型論壇，與會學校計有140校(臺方73校，日方67校)，人數超過250人，其中包含校長層級63人，出席狀況相當踴躍，顯見雙方對深化臺日教育交流之重視，堪稱臺日高等教育界一大盛事，亦為臺日雙邊高教合作開啟新頁。
本次論壇主題為「全球化時代臺日大學共同面臨之挑戰」(Globalization and the Challenges Confronting Universities in Taiwan and Japan)，並將邀請財團法人高等教育評鑑中心基金會(HEEACT)黃榮村董事長及日本國公私立大學團體國際交流委員會協議會(JACUIE)永田恭介會長進行專題演講，另就「大學因應國際化及全球化之策略」、「教育領域：全球實習、交換學生、國際合作新典範、學生就業力」及「研究領域：國際合作研究、交換研究、產學合作」3項重要議題進行專題座談，透過對話及意見交流，讓雙方能夠進一步了解對方的高教現況，凝聚具體共識，為臺日學術教育合作開創更多合作契機。
教育部林思伶政務次長於開幕致詞時表示，臺灣及日本在地理上互為近鄰，雙方應更有效利用緊密的地緣關係，透過雙方優勢創造共同合作利基，以提升學術研究與教學的品質，期盼透過論壇所建立之平臺，能夠開啟更多雙邊合作和對話的管道，更期待臺日雙方在跨境學生實習、國際合作研究及產學合作等領域可以有更多實質進展。
論壇中另安排由財團法人高等教育國際合作基金會(FICHET)代表我方與日本國公私立大學團體國際交流委員會協議會(JACUIE)簽署合作協定，確立雙方高等教育合作夥伴關係，將致力推動雙邊高教機構之教育學術交換計畫，並鼓勵辦理雙邊合作研究及相關研討會議活動等；另雙方已商定下一屆論壇將於107年在日本舉行。
依據教育部統計，100年日本來臺就學學生人數為4,193人，104年來臺就學日本學生人數已達6,319人，為我國境外生第4大來源國，更是來臺研習華語學生的第1大來源國，顯見越來越多日本學生肯定臺灣的學習環境，並選擇臺灣作為海外留學的目的地。教育部期望透過本次論壇的舉辦，能夠增進日方大學校院對我方高教環境的認識和肯定，並向更多日本學生宣傳來臺求學之優勢，讓更多日本學生認識臺灣並選擇來臺就學。