教育部為慰勉臺商學校行政人員於大陸地區從事教育工作的辛勞，表達政府對臺商學校關懷與重視，104年2月12日教育部舉行大陸地區臺商學校校務主管會議，針對十二年國教、校務發展、學生輔導、返臺升學、師資選聘及返臺升學等問題，邀請基北區高級中等學校免試入學委員會及教育部體育署等相關單位進行討論並尋求解決方案。
因應國內教育變革，並輔導學校正常營運、永續發展，教育部每年均會召集3所臺校校長及行政主管辦理「大陸地區臺商學校校務工作座談會」，針對學校營運上發生的問題與困難，充分溝通並協解決。目前在大陸地區設有東莞台商子弟學校、華東臺商子女學校及上海台商子女學校3所臺商學校，學生人數近5千名，定位為我國境外的私立學校，按臺灣教育宗旨、各級學校教育目標及現行學制辦學，與國內教育相銜接。
臺商學校秉持著「臺商到哪裡，服務到哪裡」、「深耕臺校，幸福起飛」的辦學理念，努力提升辦學成效，為照顧臺商子女並保障其權益，目前在臺商學校設立體適能檢測站已有共識，在教育部的協助下，東莞臺校已提出設立檢測站計畫，華東及上海臺校亦積極籌劃。為加強學生對臺灣深度的體驗，東莞臺校辦理學生返臺騎鐵馬環島，未來將規畫參與泳渡日月潭等鐵人三項活動；華東臺校計畫透過返臺畢業旅行活動讓學生探索臺灣之美，增加學生對臺灣本土的認識；上海臺校則透過學校「臺灣文化教育館」豐富館藏並結合資訊備設，充分展現臺灣歷史及文化，使學生對臺灣文物有更深入的了解。
臺商學校利用位於大陸地區的地理特性，時常與鄰校進行交流並建立友好關係，未來各校也將繼續致力提升師資專業素養、學生競爭力及教學品質等，以穩健校務發展，讓學生有更良好的學習環境。臺商學校在各自團隊努力及教育部輔導下，教學環境與品質均明顯提升，且學生人數逐年成長，充分發揮照顧臺商子女返國銜接就學權益，並凝聚臺商對政府向心力，臺商學校儼然已成為兩岸教育交流的重要平臺。