為促進跨境教育合作，教育部設置「教育部亞太經濟合作獎學金」，自104年起每年至少提供10個名額予在APEC（Asia-Pacific Economic Cooperation, 亞太經濟合作會議）會員體大學就讀的博士生或博士後研究人員，且申請時未持有我護照的青年來臺進行2至6個月的短期研究。
為順應「訓練人力資本成為人力資源」的趨勢，APEC自2012年至今在人力資源發展領域均強調「跨境教育合作」，目標是實現2014年APEC領袖聯合宣言及APEC部長會議聲明均提及的「2020年APEC區域內跨境學習大學學生人數達到100萬人」願景。近期最重要的具體作為之一是美國、日本及我國共同推行的「APEC獎學金」倡議，該倡議主張公私部門創立及提供獎學金、訓練與實習機會，以嘉惠APEC會員體（尤指發展中會員體）的青年學生及女性們，培養他們因應21世紀所需的技能。美國將彙整相關資訊並建構專屬網站，以供尋求在APEC區域內就讀及訓練機會的學生們利用。
「教育部亞太經濟合作獎學金」所提供來臺進行短期研究的領域，包括與臺灣人文、社會科學、文化、藝術領域及其相關比較研究，獎補助及相關權利義務內容包括：每月補助博士生研究費新臺幣2萬5,000元整、博士後研究員研究費新臺幣4萬元整，並提供受獎人由居住地至臺灣最直接航線來回經濟艙機票1張。後續教育部視辦理情形將邀請其他部會及民間企業共同參與及研商增加該獎學金名額的可行性，以吸引更多APEC會員體青年來我國就學或進行研究，同時鼓勵我國學生踴躍申請各國提供的獎學金。
整體而言，「亞太經濟合作會議」是我國目前擁有正式會員資格，且積極參與的國際組織之一。教育部自1990年以來每年固定參與APEC人力資源發展工作小組（HRDWG）暨教育發展分組會議（EDNET）及相關活動，並提出多項研究計畫案，以維持與其他會員體的互動交流，同時提升我教育成就之國際能見度。上述「APEC獎學金」計畫鼓勵APEC區域內學生及學人跨境移動，既可加強「APEC連結性架構─人與人連結」，也與教育部積極推動之「提升青年學生全球移動力計畫」目標一致，教育部將持續規劃及辦理後續相關事宜，以向APEC會員體展示我教育政策成果及成功經驗，進而推動更密切的國際教育合作及交流。